فاضلابهای بیولوژیکی فاضلابی است که حاوی موجودات زنده همچون باکتریها هستند. باکتریهای این نوع فاضلابها خطرناک بوده و می توانند موجب بیماری شوند. انواع فاضلاب بیولوژیکی :
- فاضلاب بیمارستانی و مراکز درمانی
- آلودگی آب با فاضلاب کشتارگاه ها
- فاضلاب خانگی
از مهم ترین موادی آلاینده که از طریق فاضلاب انسانی و دام ها وارد طبیعت و محیط زیست می گردد، نیترات و باکتری ها می باشند. لازم به ذکر است که باکتری های انتقال یافته از طریق فاضلاب کشتارگاه ها، بیمارستان ها و فاضلاب های خانگی و دامداری ها به شدت بر سلامت انسان اثر منفی ایجاد می کند. به طوریکه تهدید جدی برای سلامت بیماران مبتلا به سرطان و ایدز که از سیستم ایمنی ضعیف تری برخوردار هستند، به شمار می رود. به همین خاطر، استفاده از سیستم تصفیه مخصوص این نوع فاضلابهای بسیار ضروری است. زیرا سلامت عمومی جامعه را تهدید می نمایند.